Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TMIEQ8NEW7 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIEQ8NEW7 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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