Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LTBP4Q8N2S1 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LTBP4Q8N2S1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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