Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKAP1Q86WV1 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms