Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATG4DQ86TL0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ATG4DQ86TL0 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ATG4DQ86TL0 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ATG4DQ86TL0 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ATG4DQ86TL0 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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ATG4DQ86TL0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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