Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
PTF1AQ7RTS3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTF1AQ7RTS3 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms