Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARMIL2Q6F5E8 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms