Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG9BQ674R7 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG9BQ674R7 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms