Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNF628Q5EBL2 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF628Q5EBL2 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms