Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
C4orf17Q53FE4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms