Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms