Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DUSP28Q4G0W2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DUSP28Q4G0W2 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms