Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TTLL9Q3SXZ7 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TTLL9Q3SXZ7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TTLL9Q3SXZ7 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TTLL9Q3SXZ7 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TTLL9Q3SXZ7 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TTLL9Q3SXZ7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TTLL9Q3SXZ7 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TTLL9Q3SXZ7 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TTLL9Q3SXZ7 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TTLL9Q3SXZ7 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TTLL9Q3SXZ7 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TTLL9Q3SXZ7 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TTLL9Q3SXZ7 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TTLL9Q3SXZ7 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTLL9Q3SXZ7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTLL9Q3SXZ7 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTLL9Q3SXZ7 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTLL9Q3SXZ7 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTLL9Q3SXZ7 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTLL9Q3SXZ7 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TTLL9Q3SXZ7 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTLL9Q3SXZ7 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTLL9Q3SXZ7 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTLL9Q3SXZ7 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTLL9Q3SXZ7 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTLL9Q3SXZ7 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTLL9Q3SXZ7 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTLL9Q3SXZ7 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TTLL9Q3SXZ7 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms