Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 AL355478.1-201ENST00000431686 821 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PROX2Q3B8N5 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PROX2Q3B8N5 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms