Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAA8

TSNAXIP1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNAXIP1Q2TAA8 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TSNAXIP1Q2TAA8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms