Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRNQ16849 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRNQ16849 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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