Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
PCK2Q16822 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCK2Q16822 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms