Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CHRNA6Q15825 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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