Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NCOA1Q15788 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
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