Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRKQ15262 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRKQ15262 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
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