Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SEMA3AQ14563 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SEMA3AQ14563 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms