Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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COL4A6Q14031 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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COL4A6Q14031 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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COL4A6Q14031 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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COL4A6Q14031 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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COL4A6Q14031 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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COL4A6Q14031 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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COL4A6Q14031 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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COL4A6Q14031 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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COL4A6Q14031 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COL4A6Q14031 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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