Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CBFBQ13951 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms