Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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DDX39BQ13838 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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DDX39BQ13838 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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DDX39BQ13838 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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DDX39BQ13838 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
DDX39BQ13838 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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DDX39BQ13838 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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DDX39BQ13838 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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DDX39BQ13838 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DDX39BQ13838 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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