Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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