Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NFX1Q12986 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms