Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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