Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SMARCB1Q12824 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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