Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PDE4DQ08499 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PDE4DQ08499 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms