Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GABPAQ06546 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABPAQ06546 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms