Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
NHLH2Q02577 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms