Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
IRF8Q02556 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms