Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFRSF17Q02223 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms