Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MS4A2Q01362 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms