Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms