Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMAD3P84022 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms