Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SNRPNP63162 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms