Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CDH15P55291 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH15P55291 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH15P55291 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH15P55291 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH15P55291 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH15P55291 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH15P55291 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH15P55291 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH15P55291 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH15P55291 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH15P55291 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH15P55291 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH15P55291 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH15P55291 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH15P55291 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH15P55291 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH15P55291 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH15P55291 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH15P55291 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH15P55291 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH15P55291 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH15P55291 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH15P55291 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH15P55291 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH15P55291 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH15P55291 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH15P55291 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH15P55291 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH15P55291 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH15P55291 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH15P55291 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH15P55291 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH15P55291 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH15P55291 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH15P55291 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH15P55291 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH15P55291 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH15P55291 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH15P55291 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH15P55291 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH15P55291 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH15P55291 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH15P55291 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CDH15P55291 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH15P55291 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH15P55291 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH15P55291 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH15P55291 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH15P55291 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH15P55291 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH15P55291 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH15P55291 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH15P55291 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH15P55291 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH15P55291 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH15P55291 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH15P55291 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH15P55291 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH15P55291 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH15P55291 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH15P55291 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH15P55291 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH15P55291 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH15P55291 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH15P55291 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH15P55291 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH15P55291 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH15P55291 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH15P55291 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH15P55291 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH15P55291 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH15P55291 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH15P55291 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDH15P55291 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDH15P55291 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CDH15P55291 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDH15P55291 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDH15P55291 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDH15P55291 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDH15P55291 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDH15P55291 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH15P55291 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH15P55291 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH15P55291 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH15P55291 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH15P55291 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH15P55291 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH15P55291 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH15P55291 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH15P55291 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH15P55291 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH15P55291 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH15P55291 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH15P55291 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH15P55291 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH15P55291 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH15P55291 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH15P55291 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms