Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AQP4P55087 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AQP4P55087 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AQP4P55087 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AQP4P55087 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AQP4P55087 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AQP4P55087 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AQP4P55087 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AQP4P55087 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AQP4P55087 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AQP4P55087 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AQP4P55087 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AQP4P55087 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AQP4P55087 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AQP4P55087 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AQP4P55087 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AQP4P55087 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AQP4P55087 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AQP4P55087 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AQP4P55087 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AQP4P55087 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AQP4P55087 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AQP4P55087 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AQP4P55087 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AQP4P55087 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AQP4P55087 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AQP4P55087 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AQP4P55087 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AQP4P55087 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AQP4P55087 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AQP4P55087 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AQP4P55087 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AQP4P55087 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AQP4P55087 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AQP4P55087 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AQP4P55087 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AQP4P55087 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AQP4P55087 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AQP4P55087 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AQP4P55087 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AQP4P55087 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AQP4P55087 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AQP4P55087 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AQP4P55087 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AQP4P55087 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AQP4P55087 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AQP4P55087 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AQP4P55087 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AQP4P55087 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AQP4P55087 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AQP4P55087 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AQP4P55087 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AQP4P55087 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AQP4P55087 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AQP4P55087 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AQP4P55087 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AQP4P55087 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AQP4P55087 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AQP4P55087 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AQP4P55087 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AQP4P55087 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AQP4P55087 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AQP4P55087 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AQP4P55087 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AQP4P55087 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AQP4P55087 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AQP4P55087 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AQP4P55087 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AQP4P55087 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AQP4P55087 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AQP4P55087 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AQP4P55087 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AQP4P55087 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AQP4P55087 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AQP4P55087 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AQP4P55087 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AQP4P55087 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AQP4P55087 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AQP4P55087 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AQP4P55087 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AQP4P55087 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AQP4P55087 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AQP4P55087 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AQP4P55087 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AQP4P55087 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AQP4P55087 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AQP4P55087 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AQP4P55087 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AQP4P55087 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AQP4P55087 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AQP4P55087 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AQP4P55087 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AQP4P55087 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AQP4P55087 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AQP4P55087 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AQP4P55087 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AQP4P55087 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AQP4P55087 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AQP4P55087 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AQP4P55087 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms