Protein–RNA interactions for Protein: P52848

NDST1, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST1P52848 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDST1P52848 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDST1P52848 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDST1P52848 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDST1P52848 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDST1P52848 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDST1P52848 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NDST1P52848 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDST1P52848 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDST1P52848 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDST1P52848 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDST1P52848 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDST1P52848 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDST1P52848 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDST1P52848 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDST1P52848 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDST1P52848 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDST1P52848 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDST1P52848 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NDST1P52848 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDST1P52848 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDST1P52848 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDST1P52848 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDST1P52848 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDST1P52848 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDST1P52848 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDST1P52848 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDST1P52848 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDST1P52848 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDST1P52848 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NDST1P52848 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDST1P52848 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDST1P52848 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDST1P52848 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDST1P52848 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDST1P52848 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NDST1P52848 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDST1P52848 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDST1P52848 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NDST1P52848 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDST1P52848 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDST1P52848 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDST1P52848 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDST1P52848 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDST1P52848 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDST1P52848 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NDST1P52848 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDST1P52848 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDST1P52848 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDST1P52848 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDST1P52848 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDST1P52848 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDST1P52848 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDST1P52848 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDST1P52848 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDST1P52848 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDST1P52848 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDST1P52848 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDST1P52848 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDST1P52848 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDST1P52848 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDST1P52848 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDST1P52848 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDST1P52848 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDST1P52848 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDST1P52848 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDST1P52848 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDST1P52848 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDST1P52848 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NDST1P52848 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDST1P52848 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NDST1P52848 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDST1P52848 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDST1P52848 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NDST1P52848 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDST1P52848 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDST1P52848 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDST1P52848 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDST1P52848 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDST1P52848 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDST1P52848 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDST1P52848 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDST1P52848 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDST1P52848 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NDST1P52848 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NDST1P52848 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDST1P52848 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDST1P52848 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDST1P52848 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDST1P52848 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDST1P52848 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDST1P52848 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDST1P52848 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NDST1P52848 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDST1P52848 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDST1P52848 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDST1P52848 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDST1P52848 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDST1P52848 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NDST1P52848 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms