Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CASP4P49662 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CASP4P49662 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP4P49662 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP4P49662 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP4P49662 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP4P49662 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP4P49662 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP4P49662 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP4P49662 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP4P49662 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP4P49662 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP4P49662 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP4P49662 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP4P49662 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP4P49662 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP4P49662 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP4P49662 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CASP4P49662 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms