Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NESP48681 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NESP48681 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NESP48681 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NESP48681 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NESP48681 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NESP48681 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NESP48681 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NESP48681 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NESP48681 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NESP48681 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NESP48681 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NESP48681 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NESP48681 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NESP48681 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NESP48681 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NESP48681 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NESP48681 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NESP48681 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NESP48681 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NESP48681 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NESP48681 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NESP48681 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NESP48681 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NESP48681 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NESP48681 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NESP48681 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NESP48681 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NESP48681 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NESP48681 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NESP48681 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NESP48681 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NESP48681 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NESP48681 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NESP48681 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NESP48681 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NESP48681 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NESP48681 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NESP48681 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NESP48681 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NESP48681 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NESP48681 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NESP48681 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NESP48681 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NESP48681 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NESP48681 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NESP48681 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NESP48681 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NESP48681 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NESP48681 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NESP48681 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NESP48681 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NESP48681 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NESP48681 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NESP48681 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NESP48681 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NESP48681 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NESP48681 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NESP48681 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NESP48681 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NESP48681 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NESP48681 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NESP48681 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NESP48681 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NESP48681 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NESP48681 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NESP48681 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NESP48681 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NESP48681 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NESP48681 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NESP48681 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NESP48681 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NESP48681 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NESP48681 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NESP48681 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NESP48681 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NESP48681 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NESP48681 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NESP48681 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NESP48681 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NESP48681 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NESP48681 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NESP48681 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NESP48681 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NESP48681 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NESP48681 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NESP48681 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NESP48681 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NESP48681 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NESP48681 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NESP48681 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NESP48681 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NESP48681 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NESP48681 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NESP48681 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NESP48681 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NESP48681 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NESP48681 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NESP48681 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NESP48681 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms