Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GCLCP48506 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCLCP48506 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCLCP48506 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCLCP48506 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCLCP48506 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCLCP48506 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCLCP48506 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCLCP48506 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCLCP48506 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GCLCP48506 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCLCP48506 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GCLCP48506 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLCP48506 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLCP48506 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLCP48506 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLCP48506 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLCP48506 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLCP48506 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLCP48506 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLCP48506 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLCP48506 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLCP48506 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLCP48506 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLCP48506 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLCP48506 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLCP48506 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLCP48506 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLCP48506 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLCP48506 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLCP48506 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLCP48506 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLCP48506 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLCP48506 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLCP48506 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLCP48506 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLCP48506 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLCP48506 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLCP48506 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLCP48506 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLCP48506 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLCP48506 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLCP48506 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLCP48506 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLCP48506 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLCP48506 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLCP48506 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLCP48506 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCLCP48506 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLCP48506 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLCP48506 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLCP48506 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLCP48506 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLCP48506 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLCP48506 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLCP48506 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLCP48506 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLCP48506 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLCP48506 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLCP48506 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLCP48506 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLCP48506 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLCP48506 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLCP48506 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLCP48506 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLCP48506 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLCP48506 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLCP48506 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLCP48506 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLCP48506 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLCP48506 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLCP48506 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLCP48506 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLCP48506 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLCP48506 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLCP48506 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLCP48506 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLCP48506 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLCP48506 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLCP48506 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLCP48506 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLCP48506 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLCP48506 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLCP48506 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLCP48506 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLCP48506 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLCP48506 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLCP48506 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLCP48506 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCLCP48506 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLCP48506 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLCP48506 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLCP48506 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLCP48506 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLCP48506 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLCP48506 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLCP48506 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLCP48506 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLCP48506 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GCLCP48506 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms