Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ME1P48163 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ME1P48163 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ME1P48163 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ME1P48163 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ME1P48163 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ME1P48163 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ME1P48163 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ME1P48163 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ME1P48163 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ME1P48163 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ME1P48163 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ME1P48163 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ME1P48163 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ME1P48163 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ME1P48163 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ME1P48163 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ME1P48163 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ME1P48163 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ME1P48163 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ME1P48163 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ME1P48163 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ME1P48163 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ME1P48163 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ME1P48163 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ME1P48163 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ME1P48163 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ME1P48163 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ME1P48163 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ME1P48163 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ME1P48163 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ME1P48163 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ME1P48163 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ME1P48163 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ME1P48163 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ME1P48163 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ME1P48163 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ME1P48163 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ME1P48163 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ME1P48163 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ME1P48163 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ME1P48163 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ME1P48163 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ME1P48163 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ME1P48163 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ME1P48163 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ME1P48163 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ME1P48163 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ME1P48163 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ME1P48163 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ME1P48163 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ME1P48163 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ME1P48163 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ME1P48163 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ME1P48163 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ME1P48163 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ME1P48163 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ME1P48163 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ME1P48163 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ME1P48163 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ME1P48163 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ME1P48163 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ME1P48163 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ME1P48163 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ME1P48163 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ME1P48163 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ME1P48163 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ME1P48163 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ME1P48163 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ME1P48163 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ME1P48163 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ME1P48163 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ME1P48163 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ME1P48163 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ME1P48163 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ME1P48163 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ME1P48163 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ME1P48163 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ME1P48163 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ME1P48163 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ME1P48163 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ME1P48163 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ME1P48163 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ME1P48163 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ME1P48163 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ME1P48163 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ME1P48163 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ME1P48163 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ME1P48163 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ME1P48163 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ME1P48163 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ME1P48163 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ME1P48163 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ME1P48163 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ME1P48163 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ME1P48163 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ME1P48163 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ME1P48163 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ME1P48163 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ME1P48163 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms