Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSFMP43897 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSFMP43897 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSFMP43897 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSFMP43897 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSFMP43897 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TSFMP43897 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSFMP43897 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSFMP43897 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
TSFMP43897 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSFMP43897 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSFMP43897 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms