Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXD12P35452 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXD12P35452 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms