Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA9P31269 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms