Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
DUSP1P28562 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms