Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXD10P28358 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms