Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTSSP25774 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTSSP25774 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTSSP25774 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTSSP25774 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTSSP25774 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTSSP25774 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTSSP25774 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTSSP25774 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTSSP25774 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTSSP25774 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTSSP25774 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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