Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TCEA1P23193 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms